A Confederação Brasileira de Futebol (CBF) mudou o formato do Campeonato Brasileiro em 2003, quando a competição deixou de ter a parte final decidida num mata-mata para passar a ser toda no formato de pontos corridos. Curiosamente, o Cruzeiro foi o primeiro time a ser campeão nacional nesse novo modelo ao levantar a taça logo no ano de estreia.
Após muitas discussões que levaram anos, a CBF ainda reconheceu os times que venceram a extinta Taça Brasil como campeões nacionais, já que o antigo torneio passou a ser equivalente ao atual Campeonato Brasileiro. Com essa mudança significativa, o Cruzeiro ficou com mais um título de peso por ter sido o vencedor da Taça Brasil de 1996.
Desde que o formato de pontos corridos passou a ser adotado, o Cruzeiro venceu a competição três vezes. A primeira delas, como dito anteriormente, foi em 2003, ano da Tríplice Coroa (ainda venceu o Campeonato Mineiro e a Copa do Brasil). Depois disso, a Raposa ainda conquistou o bicampeonato nos anos de 2013 e 2014, quando encantou o país contando com jogadores como Fábio, Dedé, Éverton Ribeiro, Ricardo Goulart, Lucas Silva e companhia.
Cruzeiro é um dos maiores vencedores dos pontos corridos
- Corinthians: 4 títulos (2005, 2011, 2015 e 2017)
- Palmeiras: 4 títulos (2016, 2018, 2022 e 2023)
- Cruzeiro: 3 títulos (2003, 2013 e 2014)
- Flamengo: 3 títulos (2009, 2019 e 2020)
- São Paulo: 3 títulos (2006, 2007 e 2008)
- Fluminense: 2 títulos (2010 e 2012)
- Atlético-MG: 1 título (2021)
- Santos: 1 título (2004)
